研究業績

 

研究業績

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2022

  1. Soodeh Tirnaz, Naomi Miyaji, Shohei Takuno, Philipp E. Bayer, Motoki Shimizu, Mst. Arjina Akter, David Edwards, Jacqueline Batley, Ryo Fujimoto. (2022) Whole-genome DNA methylation analysis in Brassica rapa subsp. perviridis in response to Albugo candida infection. Frontiers in Plant Science 13: 849358.
  2. Mst. Arjina Akter, Hasan Mehraj, Naomi Miyaji, Satoshi Takahashi, Takeshi Takasaki-Yasuda, Motoaki Seki, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto, Kenji Osabe (2022) Transcriptional association between mRNAs and their paired natural antisense transcripts following Fusarium oxysporum inoculation in Brassica rapa L. Horticulturae 8(1) 22.
 

2021

  1. Hasan Mehraj, Satoshi Takahashi, Naomi Miyaji, Ayasha Akter, Yutaka Suzuki, Motoaki Seki, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto (2021) Characterization of histone H3 Lysine 4 and 36 tri-methylation in Brassica rapa L. Frontiers in Plant Science 12: 659634. 
  2. Naomi Miyaji, Mst Arjina Akter, Chizuko Suzukamo, Hasan Mehraj, Tomoe Shindo, Takeru Itabashi, Keiichi Okazaki, Motoki Shimizu, Makoto Kaji, Masahiko Katsumata, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto (2021) Development of a new DNA marker for Fusarium yellows resistance in Brassica rapa vegetables. Plants 10(6): 1082.
  3. Naomi Miyaji, Motoki Shimizu, Takeshi Takasaki-Yasuda, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto (2021) The transcriptional response to salicylic acid plays a role in Fusarium yellows resistance in Brassica rapa L. Plant Cell Reports 40(4): 605-619.
  4. Hasan Mehraj, Daniel J Shea, Satoshi Takahashi, Naomi Miyaji, Ayasha Akter, Motoaki Seki, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto, Kenji Osabe (2021) Genome-wide analysis of long noncoding RNAs, 24-nt siRNAs, DNA methylation and H3K27me3 marks in Brassica rapa. PLoS ONE 16(3): e0242530 
 

2020

  1. Hasan Mehraj, Ayasha Akter, Naomi Miyaji, Junji Miyazaki, Daniel J Shea, Ryo Fujimoto, Md Asad-Ud Doullah (2020) Genetics of clubroot and Fusarium wilt disease resistance in Brassica vegetables: the application of marker assisted breeding for disease resistance. Plants 9(6): 726.
  2. Hasan Mehraj, Takahiro Kawanabe, Motoki Shimizu, Naomi Miyaji, Ayasha Akter, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto (2020) In Arabidopsis thaliana heterosis level varies among individuals in an F1 hybrid population Plants 9(4): 414.
  3. Ayasha Akter, Etsuko Itabashi, Tomohiro Kakizaki, Keiichi Okazaki, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto (2020) Genome triplication leads to transcriptional divergence of FLOWERING LOCUS C genes during vernalization in the genus Brassica. Frontiers in plant science 11: 619417-619417
  4. Ayasha Akter, Junji Miyazaki, Daniel J. Shea, Namiko Nishida, Satoko Takada, Naomi Miyaji, Hasan Mehraj, Motoki Shimizu, Md. Asad-ud Doullah, Takeshi Takasaki-Yasuda, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto (2020) Gene expression analysis in response to vernalization in Chinese Cabbage (Brassica rapa L.). The Horticulture Journal 89(3): 268-277.
 

2019

  1. Etsuko Itabashi, Daniel J. Shea, Nobuko Fukino, Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki, Tomohiro Kakizaki, Takayoshi Ohara (2019) Comparison of cold responses for orthologs of cabbage vernalization-related genes. The Horticulture Journal 88(4): 462-470
  2. Ayasha Akter, Satoshi Takahashi, Weiwei Deng, Daniel J Shea, Etsuko Itabashi, Motoki Shimizu, Naomi Miyaji, Kenji Osabe, Namiko Nishida, Yutaka Suzuki, Chris A Helliwell, Motoaki Seki, William James Peacock, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto (2019) The histone modification H3 lysine 27 tri-methylation has conserved gene regulatory roles in the triplicated genome of Brassica rapa L. DNA Research 26(5): 433-443 
  3. Satoko Takada, Ayasha Akter, Etsuko Itabashi, Namiko Nishida, Daniel J Shea, Naomi Miyaji, Hasan Mehraj, Kenji Osabe, Motoki Shimizu, Takeshi Takasaki-Yasuda, Tomohiro Kakizaki, Keiichi Okazaki, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto (2019) The role of FRIGIDA and FLOWERING LOCUS C genes in flowering time of Brassica rapa leafy vegetables. Scientific Reports 9(1): 13843.
  4. Maho Sato, Motoki Shimizu, Daniel J. Shea, Mozammel Hoque, Takahiro Kawanabe, Naomi Miyaji, Ryo Fujimoto, Eigo Fukai, Keiichi Okazaki (2019) Allele specific DNA marker for fusarium resistance gene FocBo1 in Brassica oleracea. Breeding Science 69(2): 308-315. 
  5. Daniel J Shea, Namiko Nishida, Satoko Takada, Etsuko Itabashi, Satoshi Takahashi, Ayasha Akter, Naomi Miyaji, Kenji Osabe, Hasan Mehraj, Motoki Shimizu, Motoaki Seki, Tomohiro Kakizaki, Keiichi Okazaki, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto (2019) Long noncoding RNAs in Brassica rapa L. following vernalization. Scientific Reports 9(1): 9302.
 

2018

  1. Takanori Yoshida, Takahiro Kawanabe, Yina Bo, Ryo Fujimoto, Akira Kawabe (2018) Genome-wide analysis of parent-of-origin allelic expression in endosperms of Brassicaceae species, Brassica rapa. Plant & Cell Physiology 59(12): 2590-2601.
  2. Satoshi Takahashi, Kenji Osabe, Naoki Fukushima, Shohei Takuno, Naomi Miyaji, Motoki Shimizu, Takeshi Takasaki-Yasuda, Yutaka Suzuki, Elizabeth S Dennis, Motoaki Seki, Ryo Fujimoto (2018) Genome-wide characterization of DNA methylation, small RNA expression, and histone H3 lysine nine di-methylation in Brassica rapa L. DNA Research 25(5): 511-520. 
  3. Daniel J. Shea, Yuki Tomaru, Etsuko Itabashi, Yuri Nakamura, Toshio Miyazaki, Tomohiro Kakizaki, Tonu Nazmoon Naher, Motoki Shimizu, Ryo Fujimoto, Eigo Fukai, Keiichi Okazaki (2018) The production and characterization of a BoFLC2 introgressed Brassica rapa by repeated backcrossing to an F1. Breeding Science 68(3): 316-325.
  4. Daniel J. Shea, Motoki Shimizu, Etsuko Itabashi, Naomi Miyaji, Junji Miyazaki, Kenji Osabe, Makoto Kaji, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto (2018) Genome re-sequencing, SNP analysis, and genetic mapping of the parental lines of a commercial F1 hybrid cultivar of Chinese cabbage. Breeding Science 68(3): 375-380.
  5. Daniel J. Shea, Etsuko Itabashi, Satoko Takada, Eigo Fukai, Tomohiro Kakizaki, Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki (2018) The role of FLOWERING LOCUS C in vernalization of Brassica: The importance of vernalization research in the face of climate change. Crop and Pasture Science 69(1): 30-39.
  6. Satoshi Takahashi, Naoki Fukushima, Kenji Osabe, Etsuko Itabashi, Motoki Shimizu, Naomi Miyaji, Takeshi Takasaki-Yasuda, Yutaka Suzuki, Motoaki Seki, Ryo Fujimoto (2018) Identification of DNA methylated regions by using methylated DNA immunoprecipitation sequencing in Brassica rapa. Crop and Pasture Science 69(1): 107-120.
  7. Etsuko Itabashi, Kenji Osabe, Ryo Fujimoto, Tomohiro Kakizaki (2018) Epigenetic regulation of agronomical traits in Brassicaceae. Plant Cell Reports 37(1): 87-101.
  8. Ryo Fujimoto, Kosuke Uezono, Wsonoko Ishikura, Kenji Osabe, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis (2018) Recent research on the mechanism of heterosis is important for crop and vegetable breeding systems. Breeding Science 68(2): 145-158.
 

〜2017 selected publication

  1. Naomi Miyaji, Motoki Shimizu, Junji Miyazaki, Kenji Osabe, Maho Sato, Yusuke Ebe, Satoko Takada, Makoto Kaji, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki (2017) Comparison of transcriptome profiles by Fusarium oxysporum inoculation between Fusarium yellows resistant and susceptible lines in Brassica rapa L. Plant Cell Reports 36(12): 1841-1854.
  2. Kazutaka Kawamura, Motoki Shimizu, Takahiro Kawanabe, Zujing Pu, Taro Kodama, Makoto Kaji, Kenji Osabe, Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki (2017) Assessment of DNA markers for seed contamination testing and selection of disease resistance in cabbage. Euphytica 213(1) : 28.
  3. Takahiro Kawanabe, Sonoko Ishikura, Naomi Miyaji, Taku Sasaki, Li Min Wu, Etsuko Itabashi, Satoko Takada, Motoki Shimizu, Takeshi Takasaki-Yasuda, Kenji Osabe, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto (2016) Role of DNA methylation in hybrid vigor in Arabidopsis thaliana. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(43): E6704-E6711.
  4. Kaoru Tonosaki, Kenji Osabe, Takahiro Kawanabe, Ryo Fujimoto (2016) The importance of reproductive barriers and the effect of allopolyploidization on crop breeding. Breeding Science 66(3): 333-349.
  5. Li Lily, Okamura Ayaha, Nakanishi Tetsu, Fujimoto Ryo, TAKASAKI-YASUDA TAKESHIJ. (2016) Ultrastructural Changes in the stigma and upper style during floral development of Japanese pear. Electr. Microsc. Technol. Med. Biol. 29(2): 1-7.
  6. Kazutaka Kawamura, Takahiro Kawanabe, Motoki Shimizu, Atsushi J. Nagano, Natsumi Saeki, Keiichi Okazaki, Makoto Kaji, Elizabeth S. Dennis, Kenji Osabe, Ryo Fujimoto (2016) Genetic distance of inbred lines of Chinese cabbage and its relationship to heterosis. Plant Gene 5: 1-7.
  7. Natsumi Saeki, Takahiro Kawanabe, Hua Ying, Motoki Shimizu, Mikiko Kojima, Hiroshi Abe, Keiichi Okazaki, Makoto Kaji, Jennifer M. Taylor, Hitoshi Sakakibara, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto (2016) Molecular and cellular characteristics of hybrid vigour in a commercial hybrid of Chinese cabbage. BMC Plant Biology 16(1): 45. 
  8. Motoki Shimizu, Ryo Fujimoto, Hua Ying, Zi-jing Pu, Yusuke Ebe, Takahiro Kawanabe, Natsumi Saeki, Jennifer M. Taylor, Makoto Kaji, Elizabeth S. Dennis, Keiichi Okazaki (2016) Identification of candidate genes for fusarium yellows resistance in Chinese cabbage by differential expression analysis. Plant Molecular Biology 85(3): 247-257.
  9. Ryo Fujimoto, Taku Sasaki, Ryo Ishikawa, Kenji Osabe, Takahiro Kawanabe, Elizabeth S. Dennis (2012) Molecular mechanisms of epigenetic variation in plants. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 13(8): 9900-9922.
  10. Kenji Osabe, Takahiro Kawanabe, Taku Sasaki, Ryo Ishikawa, Keiichi Okazaki, Elizabeth S. Dennis, Tomohiko Kazama, Ryo Fujimoto (2012) Multiple mechanisms and challenges for the application of allopolyploidy in plants. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 13(7): 8696-8721.
  11. Ryo Fujimoto, Jennifer M. Taylor, Sachiko Shirasawa, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis (2012) Heterosis of Arabidopsis hybrids between C24 and Col is associated with increased photosynthesis capacity. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(18): 7109-7114.
  12. Ryo Fujimoto, Taku Sasaki, Hiroshi Kudoh, Jennifer M. Taylor, Tetsuji Kakutani, Elizabeth S. Dennis (2011) Epigenetic variation in the FWA gene within the genus Arabidopsis. Plant Journal 66(5): 831-843.
  13. Ryo Fujimoto, Yuki Kinoshita, Akira Kawabe, Tetsu Kinoshita, Kazuya Takashima, Magnus Nordborg, Mikhail E. Nasrallah, Kentaro K. Shimizu, Hiroshi Kudoh, Tetsuji Kakutani (2008) Evolution and control of imprinted FWA genes in the genus Arabidopsis. PLoS Genetics 4(4): e1000048.
  14. Ryo Fujimoto, Taku Sasaki, Hisashi Inoue, Takeshi Nishio (2008) Hypomethylation and transcriptional reactivation of retrotransposon-like sequences in ddm1 transgenic plants of Brassica rapa. Plant Molecular Biology 66(5): 463-473.
  15. Ryo Fujimoto, Tetsu Sugimura, Eigo Fukai, Takeshi Nishio (2006) Suppression of gene expression of a recessive SP11/SCR allele by an untranscribed SP11/SCR allele in Brassica self-incompatibility. Plant Molecular Biology 61(4-5): 577-587.
  16. Ryo Fujimoto, Keiichi Okazaki, Eigo Fukai, Makoto Kusaba, Takeshi Nishio (2006) Comparison of the genome structure of the self-incompatibility (S) locus in interspecific pairs of S haplotypes. Genetics 173(2): 1157-1167
 
 

学会発表

2022

  1. 宮路直実, 宅野将平, 藤本 龍. Brassica rapaにおける白さび病菌の感染がDNAメチル化に及ぼす影響. 園芸学会令和4年度春季大会  2022年3月 
  2. Akter Ayasha, 藤本龍. Brassica rapaにおける極晩抽性系統の春化特性評価. 日本育種学会第141回講演会  2022年3月
  3. 西村遼太郎, 溝口桃香, 張競月, 藤本龍, 安田(高崎)剛志. ニホンナシS2, S3, S4ハプロタイプのゲノム構造解析とSFBBの探索. 園芸学会令和4年度春季大会  2022年3月
  4. Mehraj Hasan, 安田剛志, 藤本龍. Prospects for increasing the density of genetic markers in Chinese cabbage linkage map using GRAS-Di technique. 園芸学会令和4年度春季大会  2022年3月
  5. Akter Mst. Arjina, Mehraj Hasan, 藤本龍. Transcriptional association of mRNAs and their paired natural antisense transcripts following Fusarium oxysporum inoculation in Brassica rapa L. 園芸学会令和4年度春季大会 2022年3月
 

2021

  1. Hasan Mehraj, Satoshi Takahashi, Naomi Miyaji, Motoaki Seki, Elizabeth S Dennis, Ryo Fujimoto. Comparative paralog histone modification states following whole genome triplication in Brassica rapa L. 2021 Cold Spring Harbor meeting: Plant Genomes, Systems Biology and Engineering (Virtual). 2021年12月
  2. 宮路直実, 鈴鴨千鶴子, 清水元樹, 進藤友恵, 板橋建, 加治誠, 勝又雅彦, 藤本龍. アブラナ科野菜における新規萎黄病抵抗性 DNA マーカーの開発. 園芸学会令和3年度秋季大会  2021年9月
  3. 進藤友恵, 大坂正明, 千葉直樹, 勝又雅彦, 鈴鴨千鶴子, 加治誠, 藤本龍, 板橋建. Brassica rapa L. における萎黄病抵抗性育種のための共優性 SSR マーカーの開発. 園芸学会令和3年度秋季大会  2021年9月
  4. Hasan Mehraj, Satoshi Takahashi, Yutaka Suzuki, Motoaki Seki, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto. Characterization of histone H3 Lysine 4 and 36 tri-methylation in Brassica rapa L. 2021 Australian Brassica Conference 2021年9月
  5. 宮路直実, 清水元樹, 鈴鴨千鶴子, 勝又雅彦, 安田(高崎)剛志, 中馬いづみ, 藤本龍. アブラナ科野菜における白さび病抵抗性DNAマーカーの開発. 園芸学会令和３年度春季大会  2021年3月
  6. 宮路直実, 安田剛志, 藤本龍. アブラナ科野菜におけるサリチル酸応答遺伝子の同定. 園芸学会令和３年度春季大会  2021年3月
  7. 北村八祥, 小栗速斗, 小堀純奈, 藤本龍, 板橋悦子. ナバナ（Brassica napus L.）の春化に必要な低温要求量と春化応答を示す生育ステージの評価. 園芸学会令和３年度春季大会  2021年3月
  8. 川又美祐, 佐藤真帆, シェイダニエル, 清水元樹, 藤本龍, 深井英吾, 岡崎桂一. Brassica rapa品種の萎黄病抵抗性とFocBr1抵抗性遺伝子の多型解析. 日本育種学会 第139回講演会  2021年3月
  9. 宮路直実, 清水元樹, 鈴鴨千鶴子, 勝又雅彦, 安田(高崎) 剛志, 中馬いづみ, 藤本龍. Brassica rapa L.における白さび病抵抗性遺伝子の同定. 日本育種学会 第139回講演会  2021年3月
  10. 宮路直実, 清水元樹, 安田(高崎)剛志, 中馬いづみ, 藤本龍. Brassica rapa L.における白さび病抵抗性機構について. 令和3年度日本植物病理学会大会  2021年3月 
 

2020

  1. 山下萌, 安田(高崎)剛志, 藤本龍. DNAメチル化転移酵素によるシロイヌナズナの雑種強勢制御機構. 日本育種学会 第138回講演会  2020年10月
  2. 村上照実, 安田 (高崎) 剛志, 藤本龍. シロイヌナズナにおけるヒストン脱アセチル化酵素HDA6が雑種強勢に及ぼす影響. 日本育種学会 第138回講演会  2020年10月
  3. 板橋 悦子, シェイ ダニエル, 吹野 伸子, 藤 本 龍, 岡崎 桂一, 柿崎 智博, 小原 隆由. キャベツにおける春化応答性の品種間差とBoFLC2遺伝子の関係. 日本育種学会第137回講演会  2020年3月
  4. 宮路 直実, 清水 元樹, 安田 ( 高崎 ) 剛志, 中 馬 いづみ, 藤本 龍. Brassica rapa L. における白さび病抵抗性遺伝子の遺伝様式の解明と抵抗性遺伝子候補の探索. 日本育種学会第137回講演会  2020年3月
  5. 西田 菜美子, 岡崎 桂一, 藤本 龍. キャベツBoFLC2 導入ハクサイ系統の春化特性. 日本育種学会第137回講演会  2020年3月
  6. 佐藤 庄人 , モジャミール ホック , シェイ ダニエルジョン, 松村 涼介, 清水 元樹, 藤本 龍, 深井 英吾, 岡崎 桂一. コールラビ茎肥大性 QTL のファインマッピング. 日本育種学会第137回講演会  2020年3月 
  7. Naomi Miyaji, Takeshi Takasaki-Yasuda, Ryo Fujimoto. Transcriptome analysis before and after salicylic acid treatments in Brassica rapa L. Plant and Animal Genome XXVIII Conference 2020年1月
 

2019

  1. 西田菜美子, シェア ダニエル, 板橋悦子, 安田剛志, 柿崎智博, 岡崎桂一, 藤本龍. 春化によりキャベツ由来のFLC2がハクサイの遺伝的背景でどのように機能するか. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月
  2. メエラジ ハサン, 松尾康大, 安田剛志, 藤本龍. Comparison of the Transcriptome profile between F1 hybrid cultivar and its parental lines at two early developmental stages in Chinese cabbage. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月 
  3. アクタ アヤシャ, 西田菜美子, 宮路直実, 安田剛志, 藤本龍. Characterization of FLOWERING LOCUS C parlors in a late flowering line of Brassica rapa. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月
  4. 西田菜美子, シェア ダニエル, 高橋聡史, 板橋悦子, アクタ アヤシャ, 宮路直実, メエラジ ハサン, 安田剛志, 柿崎智博, 関原明, 岡崎桂一, 藤本龍. ハクサイにおける長鎖非コードRNAとエピジェネティクスとの関係性. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月 
  5. 上野環太, 久保健一, 藤本龍, 高山誠司, 安田剛志. ペチュニア花粉におけるニホンナシSFBB融合タンパク質発現系の開発. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月 
  6. 野木彩未, 高畑宏基, 西村遼太郎, 藤本龍, 安田剛志. ニホンナシSホモ系統の花粉RNAからのPsSFBB配列の再構築とクローニング. 園芸学会令和元年度秋季大会  2019年9月
  7. 松尾康大, 宮路直実, 安田剛志, 藤本龍. トランスクリプトーム解析によるシロイヌナズナDDM1変異雑種における雑種強勢低減の解明について. 日本育種学会第136回講演会  2019年9月 
  8. 西田菜美子, アクタ アヤシャ, 板橋悦子, 宮路直実, メエラジ ハサン, 柿崎 智博, 岡崎 桂一, 藤本龍. アブラナ科におけるFLCパラログ間の発現量比について. 日本育種学会第136回講演会  2019年9月 
  9. Ayasha Akter, Satoshi Takahashi, Namiko Nishida, Naomi Miyaji, Takeshi Yasuda, Yutaka Suzuki, Motoaki Seki, Ryo Fujimoto. Vernalization alters histone H3 lysine 27 trimethylation at FLC locus in Brassica rapa. 2019 KSBB & SABRAO International Conference on Plant Breeding for Sustainable Development  2019年7月
  10. Hasan Mehraj, Kodai Matsuo, Motoki Shimizu, Takeshi Yasuda, Ryo Fujimoto. Identification of non-additively expressed genes at early developmental stages in an F1 hybrid cultivar of Chinese cabbage. 2019 KSBB & SABRAO International Conference on Plant Breeding for Sustainable Development  2019年7月 
  11. 宮路 直実, 清水 元樹, 加治 誠, 安田 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. 萎黄病抵抗性・感受性ハクサイ系統における萎黄病菌感染時の免疫応答 平成31年度日本植物病理学会大会  2019年3月  
  12. 藤本 龍, 高橋 聡史, 鈴木 穣, 関 原明, 安田 剛志. ハクサイにおける全ゲノムメチル化解析. 園芸学会平成３１年度春季大会  2019年3月
  13. 西田菜美子, Daniel J Shea, 板橋 悦子, Ayasha Akter, 宮路 直美, Hasan Mehraj, 柿崎 智博, 岡崎 桂一, 藤本 龍. ハクサイにおけるノンコーディングRNAの同定. 日本育種学会第135回講演会  2019年3月
  14. アクタ アヤシャ, 宮路 直実, 安田 剛志, 藤本 龍. Distribution of histone H3 lysine 27 trimethylation in different tissues of Brassica rapa. 園芸学会平成３１年度春季大会  2019年3月
 

〜2018　抜粋

  1. 藤本 龍. アブラナ科野菜における雑種強勢研究の動向. 平成30年度野菜花き課題別研究会 「アブラナ科野菜における育種と栽培の現状と展望」  2018年10月 
  2. 上園 倖輔, シェア ダニエル, 清水 元樹, 板橋 悦子, ハサン メエラジ, 岡崎 桂一, 安田, 高崎, 剛志, 藤本 龍. ハクサイ初期生育期における子葉および本葉サイズ関連遺伝子の探索. 日本育種学会第134回講演会  2018年9月 
  3. 高橋侑也, 藤本龍, 安田 剛志. ニホンナシSホモ系統における花柱内の和合・不和合花粉管伸長. 園芸学会平成30年度秋季大会  2018年9月
  4. 張競月, 武矢悠太郎, 藤本龍, 安田 剛志. ニホンナシS3-RNase周辺領域のBACコンティグの拡張によるPpSFBB3の探索. 平成30年度園芸学会近畿支部会大阪大会  2018年9月
  5. Namiko Nishida, Daniel J. Shea, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto. How Brassica oleracea FLOWERING LOCUS C2 works in a Brassica rapa genetic background. AusCanola2018  2018年9月
  6. Naomi Miyaji, Motoki Shimizu, Takeshi Takasaki-Yasuda, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto. Transcriptome Difference by Fusarium inoculation between Fusarium yellows resistant and susceptible lines in Brassica rapa L. INTERNATIONAL PLANT MOLECULAR BIOLOGY 2018, 2018年8月 
  7. Ryo Fujimoto, Ayasha Akter, Satoshi Takahashi, Takeshi Takasaki-Yasuda, Yutaka Suzuki, Elizabeth S. Dennis, Motoaki Seki. Characterization of epigenetic states in Brassica rapa L. Brassica 2018, 2018年7月
  8. Naomi Miyaji, Etsuko Itabashi, Takeshi Takasaki-Yasuda, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto. DDM1 has an important function on heterosis in Arabidopsis thaliana. The 25th International Congress on Sexual Plant Reproduction  2018年6月 
  9. 宮路 直実, 清水 元樹, 加治 誠, 安田 (高, 崎, 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. 萎黄病菌キャベツ分離菌抵抗性遺伝子DNAマーカーで萎黄病菌コマツナ分離菌抵抗性を予測できるか? 園芸学会平成30年度春期大会  2018年3月 
  10. 上園 倖輔, Shea Daniel, 清水 元樹, 板橋 悦子, 宮路 直美, 岡崎 桂一, 安田, 高崎, 剛志, 藤本 龍. ハクサイ市販品種'W77'の両親系統間リシークエンスによる片親特異的遺伝子変異の同定. 園芸学会平成30年度春期大会  2018年3月
  11. 西田 菜美子, 高田 紗都子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 安田 剛志, 藤本 龍. Brassica rapaにおける春化経路関連遺伝子の機能解析. 園芸学会平成30年度春期大会  2018年3月
  12. 宮路 直実, 清水 元樹, 高田 紗都子, 加治 誠, 安田, 高崎, 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. 萎黄病抵抗性•感受性ハクサイ系統における萎黄病菌感染時転写応答の解明. 園芸学会平成29年度秋期大会  2017年9月
  13. 譚 永, 上園 倖輔, 板橋 悦子, 安田, 高崎, 剛志, 藤本 龍. ハクサイ市販品種'W77'における初期生育の雑種強勢関連領域の同定にむけて. 平成29年度園芸学会近畿支部滋賀大会  2017年9月テキスト
  14. 西村 遼太郎, 安藤 肇, 藤本 龍, 安田, 剛志. ニホンナシS2およびS4ハプロタイプ間のゲノム構造比較. 園芸学会平成29年度秋期大会  2017年9月 
  15. 高田 紗都子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 安田 剛志, 藤本 龍. Brassica rapa L.における春化によるFLCのエピジェネティックな修飾変化の系統間比較. 園芸学会平成29年度秋期大会  2017年9月
  16. Naomi Miyaji, Sonoko Ishikura, Satoko Takada, Takeshi Takasaki-Yasuda, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto. DDM1 is required for a full level of heterosis in Arabidopsis thaliana. Plant Biology 2017, 2017年6月
  17. 高橋 侑也, 李 麗怡, 岡村 彩葉, 藤本 龍, 安田 (高崎) 剛志. ニホンナシ柱頭の表面および微細構造の変化と柱 頭浸出液の出現について. 医学生物学電子顕微鏡技術学会第33回学術講演会  2017年5月
  18. 西本 良太, 宮路 直実, 藤本 龍, 土佐 幸雄, 中馬 いづみ. Brassica rapa L. におけるアブラナ科植物白さび病抵抗性遺伝子の探索と検出. 平成29年度日本植物病理学会大会  2017年4月
  19. 宮路 直実, 清水 元樹, 高田 紗都子, 加治 誠, 安田 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. トランスクリプトーム解析を用いたハクサイの萎黄病菌感染時における免疫応答調査. 日本育種学会第131回講演会  2017年3月
  20. 高田 紗都子, 石倉 園子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 清水 元樹, 安田 剛志, 藤本 龍. シロイヌナズナの早期開花エピ変異体の形質評価. 日本育種学会第131回講演会  2017年3月
  21. Satoko Takada, Etsuko Itabashi, Naomi Miyaji, Takeshi Takasaki-Yasuda, Kenji Osabe, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto. The epigenetic regulation of FLC expression by vernalization in Brassica rapa L. Brassica 2016, 2016年10月
  22. Naomi Miyaji, Motoki Shimizu, Satoko Takada, Takeshi Takasaki-Yasuda, Makoto Kaji, Kenji Osabe, Elizabeth S. Dennis, Keiichi Okazaki, Ryo Fujimoto. Identification of the Fusarium yellows resistance genes; its application for marker-assisted selection in Brassica rapa. Brassica 2016, 2016年10月.
  23. Naoki Fukushima, Satoshi Takahashi, Etsuko Itabashi, Motoki Shimizu, Kenji Osabe, Takeshi Yasuda, Yutaka Suzuki, Motoaki Seki, Elizabeth S. Dennis, Ryo Fujimoto. Genome-wide analysis of DNA methylation in Chinese cabbage. Brassica 2016, 2016年10月
  24. Ryo Fujimoto, Motoki Shimizu, Naomi Miyaji, Satoko Takada, Naoki Fukushima, Makoto Kaji, W. James Peacock, Elizabeth S. Dennis. Characterization of early developmental and yield heterosis in Chinese cabbage. Brassica 2016, 2016年10月 
  25. 宮路 直実, 清水 元樹, 高田 紗都子, 加治 誠, 安田 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. 萎黄病菌を接種したときの抵抗性と感受性ハクサイ系統のトランスクリプトームプロファイリング. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月 
  26. 宮路 直実, 清水 元樹, 高田 紗都子, 加治 誠, 安田 剛志, 岡崎 桂一, 藤本 龍. ハクサイにおける萎黄病菌感染時のトランスクリプトーム解析による病害反応遺伝子の調査. 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月
  27. 福島 尚樹, 高橋 聡史, 板橋 悦子, 清水 元樹, 安田 剛志, 鈴木 穣, 関 原明, 藤本 龍. ハクサイにおけるメチローム解析. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月
  28. 武矢 悠太郎, 野村 直希, 藤本 龍, 安田, 剛志. ニホンナシS3-RNase 周辺BACコンティグの塩基配列解析. 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月
  29. 西村 遼太郎, 藤本 龍, 安田 剛志, ニホンナシS2遺伝子座のゲノム構造および発現遺伝子解析. 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月
  30. 宮路 直実, 石倉 園子, 高田 紗都子, 板橋 悦子, 安田 剛志, 藤本 龍. シロイヌナズナの雑種強勢に関与する遺伝子領域の探索. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月
  31. 石倉 園子, 宮路 直実, 板橋 悦子, 高田 紗都子, 高橋 聡史, 清水 元樹, 安田 剛志, 関 原明, 藤本 龍. クロマチンリモデリング因子DDM1によるエピジェネティックな制御がシロイヌナズナのヘテローシスに及ぼす影響. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月
  32. 西本 良太, 宮路 直実, 藤本 龍, 土佐 幸雄, 中馬 いづみ. アブラナ科植物白さび病菌Albugo candidaに対する抵抗性遺伝子同定に向けたBrassica rapa抵抗性品種の選抜. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月
  33. 福島 尚樹, 高橋 聡史, 板橋 悦子, 清水 元樹, 安田 剛志, 鈴木 穣, 関 原明, 藤本 龍. Whole genome bisulfite sequencingによるハクサイのDNAメチル化領域の探索. 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月 
  34. 高田 紗都子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 安田 剛志, 藤本 龍. Brassica rapa L.の開花期の決定におけるFRIGIDAとFLOWERING LOCUS Cの役割. 日本育種学会第130回講演会  2016年9月
  35. 高田 紗都子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 清水 元樹, 安田 剛志, 藤本 龍. Brassica rapa L.における春化によるFLOWERING LOCUS C のエピジェネティックな転写制御について, 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月 
  36. 高田 紗都子, 板橋 悦子, 宮路 直実, 安田 剛志, 藤本 龍. Brassica rapa L.における開花関連遺伝子FRIGIDA の発現解析および全長配列の決定. 園芸学会平成28年度秋季大会  2016年9月
  37. 武矢 悠太郎, 野村 直希, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシS3-RNase 周辺領域451kb のゲノム構造解析. 平成28 年度園芸学会近畿支部兵庫大会  2016年8月 
  38. 西村 遼太郎, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシS2-RNase 周辺領域663kb のゲノム構造解析. 平成28 年度園芸学会近畿支部兵庫大会  2016年8月
  39. 西村 遼太郎, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシSホモ系統の花粉cDNAからのPpSFBB2ホモログのクローニングII. 平成27年度秋季大会  2015年9月  園芸学会
  40. 阿部 寛史, 川辺 隆大, 佐伯 なつみ, 清水 元樹, 今野 周平, 永野 惇, 本庄 三恵, 八杉 公基, 工藤 洋, 畠山 勝徳, 松元 哲, 岡崎 桂一, 加治 誠, 藤本 龍. ハクサイ市販一代雑種品種‘W77’における雑種強勢に関わるQTLの探索. 日本育種学会第126回講演会  2014年9月 
  41. 李 麗怡, 時安 美奈, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシ和合・不和合花粉管へのS-RNaseの取り込み. 平成26年度秋季大会  2014年9月  園芸学会
  42. 西村 遼太郎, 今村 剛士, 加藤 大貴, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシSホモ系統の花粉cDNAからのPpSFBB2ホモログのクローニング. 平成26年度秋季大会  2014年9月  園芸学会
  43. 安藤 肇, 山下 翔人, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシS4-RNase周辺BACコンティグの拡張によるPpSFBB遺伝子群の探索. 平成26年度秋季大会  2014年9月  園芸学会
  44. 時安 美奈, 李 麗怡, 岡村 彩葉, 藤本 龍, 安田 剛志. ニホンナシnon-S-RNaseの花柱組織における蓄積と花粉管への取り込み. 平成26年度秋季大会  2014年9月  園芸学会
  45. 佐伯 なつみ, 川辺 隆大, 野瀬 笙子, 阿部 寛史, 加治 誠, 岡崎 桂一, 藤本 龍. ハクサイ市販一代雑種品種‘W39’における雑種強勢関連遺伝子の発現解析. 園芸学会平成26年度春季大会  2014年3月
  46. 阿部 寛史, 川辺 隆大, 野瀬 笙子, 佐伯 なつみ, 清水 元樹, 今野 周平, 加治 誠, 岡崎 桂一, 藤本 龍. ハクサイ市販一代雑種品種W77及びそのF2後代の形質調査. 日本育種学会第125回講演会  2014年3月
  47. 佐伯なつみ, 野瀬 笙子, 川辺 隆大, 阿部 寛史, 岡崎 桂一, 加治 誠, 藤本 龍. RNA-sequencing法によるハクサイ市販F1品種の両親系統間のSNP同定. 日本育種学会第125回講演会  2014年3月
  48. 佐伯 なつみ, 川辺 隆大, 阿部 寛史, 加治 誠, 岡崎 桂一, 藤本 龍. ハクサイ市販F1品種‘W39’の生育初期に見られる雑種強勢について. 日本育種学会第124回講演会  2013年10月
  49. 佐伯 なつみ, 川辺 隆大, 阿部 寛史, 今野 周平, 清水 元樹, 加治 誠, 藤本 龍. ハクサイF1品種W39における生育初期及び収穫期の雑種強勢の評価. 園芸学会平成25年度秋期大会  2013年9月 
  50. SAEKI NATSUMI, KAWANABE TAKAHIRO, ABE HIROFUMI, SHIMIZU MOTOKI, KONNO SHUHEI, KAJI MAKOTO, FUJIMOTO RYO. A large cotyledon area after germination is a common phenomenon in heterotic F1 hybrids of Arabidopsis thaliana and Chinese cabbage. 24th International Conference on Arabidopsis Research  2013年6月 
 

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